1984年、ゴジラが新宿を襲撃した際、その被災現場からゴジラ細胞 (G細胞)を、中東サラジア国のエージェントが密かに盗み出していた。その国では遺伝子工学の権威・白神博士がG細胞の研究を行っていた。しかし、「バイオ・メジャー」と名乗る集団に研究所は破壊され、博士は1人娘の英理加を失ってしまう。